La Biblioteca possiede un notevole fondo di carattere specialistico, prevalentemente indirizzato allo studio della storia, dottrina e spiritualità francescana nel quale sono toccati temi storici, teologici, filosofici, letterari, artistici, che in san Francesco trovano l’avvio e si completano attraverso i secoli.
È disponibile una letteratura specializzata di circa 10.000 volumi comprendenti numerose
- opere e collane (Corpus des Sources fraciscaines; Fontes franciscani; Opuscula sancti Francisci; “Opera omnia” di san Bonaventura, beato Duns Scoto, san Bernardino da Siena, san Giovanni da Capestrano, san Lorenzo da Brindisi; “Summa Theologica” di Alessandro di Hales; “Sinica Franciscana”; “Bibliotheca Franciscana Scholastica Medii Aevi”; “Spicilegium bonaventurianum”; “Biblioteca bio-bibliografica della Terra Santa”; “Bullarium franciscanum”; “Annales Minorum”; “Analecta franciscana”; collana “Bibliotheca Seraphico-Capuccina” dell’Istituto Storico dei Cappuccini, “Fonti e ricerche” delle Editrici Francescane, “Studi e testi francescani” delle Edizioni Francescane, “Medioevo francescano – Saggi” della S.I.S.F. delle Edizioni Porziuncola, “Viator” delle Edizioni Porziuncola; “Atti dei convegni” della S.I.S.F. del Centro Italiano di studi sull’Alto Medioevo);
- periodici (Medioevo latino; Archivum franciscanum historicum; Frate Francesco; Studi Francescani; Vita Minorum; Acta Ordinis Fratrum Minorum; Analecta TOR; Il Santo; Laurentianum; Collectanea franciscana; Bibliographia franciscana; Miscellanea francescana; Antonianum; Franciscana; Miscellanea Franciscana Salentina; Forma Sororum).